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                                                STR遺傳標記分析服務

                                                短串聯重復序列(short tandem repeat, STR),也稱微衛星DNA(microsatellite DNA),是指以少數幾個核苷酸(多數為2-6個)為單位多次串聯重復的DNA序列。由于重復單位及重復次數不同,使其分布具有很大的差異性,構成了STR的遺傳多態性,并按孟德爾規律呈共顯性遺傳。由于STR具有種屬特異性、適合于復合擴增、使其在作物種質鑒定、親緣關系分析、法醫和親子鑒定等領域都得到了廣泛的應用。

                                                STR 作為遺傳標記有以下優點:

                                                l 片段短,可以復合擴增,提高識別能力

                                                l 多態性程度高,等位基因多,鑒別能力強(在每個STR 位點上,多有幾個到幾十個等位片段)

                                                l 適合于陳舊的樣品,檢測能力強

                                                l 靈敏度高,有利于微量樣品的檢測

                                                 

                                                STR檢測的應用:

                                                1 品種鑒定

                                                2 系譜分析

                                                3 法醫及親子鑒定

                                                4 群體間遺傳距離分析

                                                5 進化和遺傳多樣性研究

                                                 

                                                實驗流程

                                                STR位點序列的獲取→ 基因組DNA提取→ 熒光標記引物設計、合成→ 多重PCR擴增→ 毛細管電泳檢測→ Genemapper軟件分析數據

                                                  



                                                服務特色:

                                                l ABI 3730xl遺傳分析系統,速度快,準確度高

                                                l 自有多種熒光探針合成,使用多熒光+內標的檢測方式,通量大、速度快,并有效保證結果準確性

                                                l ABI GeneMapper 4.0或Genemarker軟件自動完成數據獲取和處理分析,為后期結果分析提供可靠數據

                                                l 大批量樣品,可免費代為PCR擴增

                                                 

                                                服務方案:

                                                l 跑板:客戶提供特異性擴增的PCR產物及PCR鑒定電泳圖,將PCR產物上機檢測并軟件自動讀取實驗結果,提供原始實驗結果及簡單結果分析

                                                l STR全套實驗服務:根據客戶實驗需求,選取合適的STR位點、設計引物,并進行預實驗以優化出的最佳實驗方案。熒光修飾引物合成,根據優化方案進行正式STR擴增和檢測實驗,將數據進行分析整理,形成最終報告提交客戶。

                                                 

                                                客戶提供STR位點信息:

                                                STR位點上下游各250bp序列,重復單位個數相關信息

                                                 

                                                STR分析所需樣品的要求:

                                                l DNA樣品:濃度≥20ng/ul,體積≥10ul(若位點數較多,則按1ul/位點準備),純度OD 260/280在1.7~1.9 之間。如果客戶要求提供樣品純化服務,我們將收取純化費;

                                                l 96孔板寄送DNA樣品時,請用硅膠墊蓋緊,并用錫紙包裹,以免樣品滲漏或者熒光衰減;

                                                l 寄送樣品時,請在送樣包裹中放置足量的冰袋,以減少在運輸過程中因溫度變化導致DNA降解的可能。

                                                 

                                                檢測周期

                                                常規檢測任務1-3周內完成,具體時間根據STR位點及樣本數而定。

                                                 

                                                我們提交結果

                                                l Genemapper分析圖譜(PDF格式)及原始fsa格式峰型圖

                                                l 各峰的相對分子量等具體信息(Excel格式)

                                                l 完整實驗報告(包括引物序列、擴增反應體系,實驗步驟等)

                                                l 數據分析軟件及使用說明

                                                 

                                                聯系方式

                                                郵箱:snp@generay.com.cn

                                                電話:021-67840429

                                                 


                                                 

                                                  

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